Маршрут наверное 109, а не 113 исходя из http://fotobus.msk.ru/photo/975192/

Нет, как раз-таки 113 :). Просто автобус сделал последний рейс из к/с "Красная Гора" по 113 на 18-20 (это рейс не до АВ, а до улицы Вершинина), На остановке сменил табличку 113 на 109 и поехал по Вершинина в сторону АВ, чтобы потом поехать по маршруту 109 до к/с "Малахит" и сделать на нём два последних его рейса на 19-00 и 19-50 с АВ.

Получается рейсы по маршруту 109 и 113 выполняет 1 и тот же автобус?

Вообще, по идее, на каждом из этих маршрутов работает 1 единица техники. Но дело к окончанию садово-ягодного сезона, последние рейсы ( 109 - в 20-40 с АВ и 21-00 от к/с "Малахит", 113 - 20-30 с АВ и 20-50 от к/с "Красная Гора"), да и утром у 109 два первых рейса не от АВ которые, а от Зелёного Бора-2 отменены (низкий пассажиропоток, светлеет поздно и темнеет рано). Видимо, решили сделать так, чтобы эти автобусы сделали примерно одинаковое количество рейсов. Вот расписание с 31 августа у 109...
Зелёный Бор-2: 8-40
Автовокзал: 9-40, 10-30, 11-20, 12-10, 13-00, 14-30, 16-20, 17-20, 18-10, 19-00, 19-50
к\с "Малахит": 9-10, 10-00, 10-50, 11-40. 12-30, 13-20, 14-50, 16-40 (до З-Бора-2), 17-40, 18-30, 19-20, 20-10 ( до З-Бора-2)
... и у 113
Автовокзал: 9-10, 10-00, 13-30, 18-00,
к\с. "Красная Гора" : 9-30*, 10-20*, 13-50**, 18-20**,
* - до АВ
** - до Детской поликлинники

В пик лета на 109 добавляются рейсы от З-Бора-2 на 8-20 и 9-20 (соотв.от "Малахита" на 8-50 и 9-50) по выходным дням и вечером рейс на 20-40 с АВ (21-00 с "Малахита" через З-Бор-2), выполянемый ежедневно. То есть до 10 утра на 109 вообще два автобуса работают, а потом - один. У 113 добавляется рейс на 20-30 с АВ ( 20-50 от "Красной Горы" до Детской поликлиники).