На 7к и 57 тоже.

И тем не менее до окончательного бегства ВАПа эта маршрутка была нелегалом.

Ну да. Хорошо известно, что 88 маршрутка в конце истории работала как "подмога" 88 автобусу, аналогично и 6э в недавнее время. По временным разрешениям все. Думаю, что здесь была аналогичная ситуация.
Не будет никто ради нескольких ГАЗелей подставляться под угрозу лишиться несколькиз своих маршрутов. Когда хотят сделать это, пускают нелегал под какими-то другими ООО или ИП. Как пример тот же нелегал 5,который до того был официальным 5с, там сразу вместо Галанта сменили на ИП. Здесь этого не было.