Томская область, Шегарский район

И.о. генерального директора: Лещеня Юрий Михайлович.
(ранее директор: Лазерко Вячеслав Николаевич).
До 1991 года имело филиалы в Молчаново (затем Молчановское АТП) и Кривошеино (затем Кривошеинское АТП). Ранее также имело филиал в Кожевниково (затем Кожевниковское АТП).
Выпуск автобусов Шегарского АТП на маршруты на 1992 год.
Обслуживаемые маршруты:

• 1 Мельниково – Бушуево (по апрель 2021 года и с апреля 2022 года)
• 2 Мельниково - Батурино (по апрель 2021 года и с апреля 2022 года)
• 4 Мельниково – Гынгазово – Вороновка (с января 2023 года)
• 5 Мельниково - Подоба (по апрель 2021 года и с апреля 2022 года)
• 6 Мельниково - Федораевка (по апрель 2021 года и с апреля 2022 года)
• 7 Мельниково - Победа (по апрель 2021 года и с июля 2022 года)
• 8 Мельниково - Нащёково - Агрогородок (по апрель 2021 года и с июля 2022 года)
• 9 Райцентр (по апрель 2021 года и с апреля 2022 года)
• 13 Мельниково – Старая Шегарка (по апрель 2021 года и с июля 2022 года)
• 309 Мельниково - Томск (по 30 июня 2020 года; с 22 августа 2023 года)
• 512 Томск - Киреевск (по апрель 2021 года и с апреля 2022 года)
• 522 Томск - Мельниково - Бакчар (с января 2021 года по апрель 2021 года и с апреля 2022 года)
• Кожевниково - Хмелёвка – Муллова (с июля 2022 года)
• Кожевниково – Батурино – Базой (с июля 2022 года)
• Кожевниково – Борзуновка (с июля 2022 года)
• Кожевниково – Десятово (с июля 2022 года)

Ранее обслуживаемые маршруты:

• Томск - Мельниково - Вороновка
• 3 Мельниково - Гынгазово (по апрель 2021 года и с июля 2022 года по 31 декабря 2023 года)
• 4 Мельниково - Вороновка (по апрель 2021 года и с июля 2022 года по 31 декабря 2023 года)
• 10 Мельниково - Баткат (по апрель 2021 года)
• 11 Мельниково - Трубачево (по апрель 2021 года)
• 12 Мельниково - Каргала (по апрель 2021 года)
• 133 Томск - Курлек (с августа-сентября 2020 года по апрель 2021 года)
• 134 Томск - Моряковский Затон (с июля 2020 года по апрель 2021 года)
• 301 Томск - Верхне-Сеченово (с августа 2020 года по апрель 2021 года)
• 509 Мельниково - Томск
• 509К Томск - Нелюбино
• 509Э Мельниково - Томск

Обслуживает маршруты:
Междугородние:

• 1 Молчаново - Колбинка - Тунгусово - Молчаново (кольцевой маршрут) (с лета 2019 года)
• 2 Молчаново - Сарафановка - Майково (с лета 2019 года)
• 3 Молчаново - Сулзат (с лета 2019 года)
• 1 Кривошеино - Вознесенка (с 15.06.2020)
• 2 Кривошеино - Никольское (с 16.06.2020)
• 3 Красный Яр - Никольское (с января 2024 года)
• 4 Кривошеино - Новоисламбуль (с января 2024 года)
• 511 Томск - Кривошеино (с 2017 года)
• 524 Томск - Молчаново - Нарга (с лета 2019 года)
• 537 Кожевниково - Томск (с июня 2025 года)

Ранее обслуживаемые:

• 1 ПМК - Агрохимия (Мельниково)
• 558 Томск - Парабель (с 18 октября 2018 года по 2019 год)
• 528 Томск - Подгорное (с 28 сентября по конец ноября 2018 года; с 01.07.2020 по 07.02.2021)